10.16535/j.cnki.dlhyxb.2019.04.004
金乌贼微卫星标记开发及两个野生群体遗传多样性比较
为进一步了解金乌贼Sepia esculenta野生群体遗传多样性水平,采用磁珠富集法从金乌贼基因组中开发了微卫星标记,并应用青岛 ( QD) 金乌贼野生群体对其多态性进行评价,进而比较了青岛和长江口(CJK) 两个野生群体的遗传差异.结果表明: 开发标记的种群遗传学评价显示,在269个克隆子中,有192个含有微卫星序列 (71. 38%),基于该序列设计85对引物,其中20对通过筛选,完美型占60%,非完美型占10%,复合型占30%;经群体验证,表观等位基因数 ( A) 为2~17不等,平均为8. 15,观测杂合度 (HO) 分布范围为0. 146~0. 936,平均为0. 630,期望杂合度 ( HE ) 分布范围为0. 172~0. 930,平均为0. 702;其中5个位点不符合哈迪—温伯格 ( Hardy－Weinberg) 平衡预期,存在零等位基因可能是其偏离平衡的原因;应用本研究开发的引物对2个近源种扩增,开发的20个标记位点中有6个在针乌贼Sepia andreana中表现为多态, 4个位点在曼氏无针乌贼Sepiella maindroni中表现为多态;应用开发的11个位点对青岛和长江口两个野生群体进行遗传差异分析显示,所有位点中,青岛群体共检测到163个等位基因,长江口群体共检测到152个等位基因,每个位点的等位基因数为5~28和6~26不等,平均等位基因数分别为14. 818和13. 818;青岛群体独有等位基因19个,观测杂合度分布范围为0. 250~0. 936,平均为0. 731,期望杂合度分布范围为0. 265~0. 930,平均为0. 771,多态信息含量为0. 223~0. 946,平均为0. 746;长江口群体独有等位基因8个,观测杂合度分布范围为0. 500~0. 896,平均为0. 731,期望杂合度分布范围为0. 623~0. 960,平均为0. 857,多态信息含量为0. 614~0. 948,平均为0. 845;群体间遗传分化较弱 ( Fst值为0. 032 5),群体分配分析结果表明,两个种群中所有个体正确分配到各自种群的概率分别为86. 4%和84. 0%.研究表明,本试验中开发的微卫星标记位点多样性水平略低于前人的研究,但有一定的跨种扩增通用性,长江口群体多样性水平略高于青岛群体,尽管两个群体间遗传分化程度不高,但存在明显差异.
金乌贼、微卫星标记、野生群体、遗传多样性
34
Q789(基因工程（遗传工程）)
山东省现代农业产业技术体系贝类产业创新团队项目 SDAIT－14－11
2019-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共10页
482-491
