尖裸鲤实时荧光定量PCR内参基因的筛选

摘要：

为筛选能够稳定表达的内参基因用于尖裸鲤Oxygymnocypris stewarti实时荧光定量PCR分析, 以尖裸鲤血液、心脏、肝、脾、鳃、头肾、中肾、后肾、前肠、中肠、后肠、性腺、眼、垂体、脑、红肌、白肌和皮肤18个组织为材料, 应用实时荧光定量PCR技术比较了GAPDH (3-磷酸甘油醛脱氢酶)、 HPRT1 (次黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖转移酶1)、 RPL13 (核糖体蛋白L13)、 RPL19 (核糖体蛋白L19)、 RPL13a (核糖体蛋白L13a)、 SDHA (琥珀酸脱氢酶亚基A) 和ACTB (β-肌动蛋白) 7个候选内参基因的表达情况,并采用GeNorm、 NormFinder和BestKeeper软件对7个候选内参基因的稳定性进行分析.结果表明: GeNorm分析显示, 7个候选内参基因的平均表达稳定值 ( M) 依次为 RPL13=RPL13a<RPL19<GAPDH<ACTB<SDHA<HPRT1, 其中RPL13和RPL13a的M值均最小 (0.62); NormFinder分析显示, 7个候选内参基因的M值依次为RPL13<RPL13a<RPL19<GAPDH<ACTB<SDHA<HPRT1, 其中RPL13的M值最小 (0.30); Best-Keeper分析显示, 7个候选内参基因的标准差 ( S.D.) 依次为 RPL13<RPL19<GAPDH<HPRT1<RPL13a<SDHA<ACTB, 变异系数 (CV) 值依次为RPL13<RPL19<HPRT1<GAPDH<SDHA<RPL13a<ACTB, 其中RPL13的标准差 (0.84) 和变异系数 (4.54%) 均最小; 7个候选内参基因在尖裸鲤不同组织中的表达量存在差异.研究表明, 7个内参基因中RPL13的表达较为稳定, 可作为尖裸鲤实时荧光定量PCR分析的适宜内参基因, 本研究结果可为尖裸鲤遗传学及分子生物学等研究提供基础数据.

关键词：尖裸鲤、实时定量PCR、内参基因

所属期刊栏目：34

分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：农业农村部财政专项;黑龙江省自然科学基金资助项目C2017013

在线出版日期：2019-09-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：370-375