不同养殖时期刺参肠道内菌群结构的分析

摘要：

为研究不同养殖时期刺参Apostichopus japonicus肠道内的细菌菌群结构,采用PCR-DGGE技术对DGGE凝胶中的主要条带进行切割、回收、克隆、测序.结果表明:3、4、5、6、9、10月,大连瓦房店海区养殖刺参肠道内细菌16S rDNA-V3可变区序列经PCR扩增及DGGE电泳后分别获得49、49、54、53、52、51个条带;3月与9月的菌群结构相似度最高,为67.9％,4月与10月次之,为63.8％;经条带序列分析得到43个主要条带对应的核酸序列,11个与未培养菌相似,32个与归属为7个细菌类群的细菌序列相似,包括α-变形菌纲、γ-变形菌纲、δ-变形菌纲、黄杆菌纲、蓝藻纲、绿弯菌门、疣微菌门;α-变形菌纲、γ-变形菌纲、黄杆菌纲是不同养殖时期刺参肠道内的主要细菌群落,其中γ-变形菌纲所占比例最高,达25.00％～35.71％,除3月和9月外,黄杆菌纲的相对含量均高于α-变形菌纲.研究表明,春秋两季刺参肠道内菌群结构呈现类似的演替变化规律,α-变形菌纲所占比例下降,而γ-变形菌纲与黄杆菌纲所占比例上升.

关键词：刺参、肠道内含物、变性梯度凝胶电泳、菌群结构

所属期刊栏目：30

分类号：Q959;S94(动物学)

资助基金：辽宁省科技攻关重大项目2015203003;国家海洋局海洋公益项目201405003;国家“863”计划项目2012AA10A412

在线出版日期：2015-10-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：345-350