秋、 冬季刺参养殖池塘菌群的多样性分析

摘要：

以黄海和渤海代表性刺参养殖池塘秋、 冬季海水和沉积物基因组DNA为模板, 以细菌16S rDNA通用引物进行PCR扩增, 构建16S rDNA文库并进行测序分析, 研究了秋、 冬季刺参养殖池塘菌群的多样性.结果表明: 海水和沉积物中主要包括11 个门类的细菌, 即变形菌门(Proteobacteria)、 酸杆菌门(Acidobacteria)、 放线菌门(Actinobacteria)、 拟杆菌门(Bacteroidetes)、 疣微菌门(Verrucomicrobia)、 厚壁菌门(Firmicutes)、 梭杆菌门(Fusobacteria)、 蓝细菌门(Cyanobacteria)、 浮霉菌门(Planctomycetes)、 脱铁杆菌门(Deferribacteres)、 绿弯菌门(Chloroflexi); 黄海和渤海刺参养殖池塘海水和沉积物中优势类群均为变形菌(变形菌比例>48%); 用Shannon指数及Simpson优势度指数分析细菌的多样性, 黄、 渤海刺参养殖池塘中, 冬季沉积物细菌Simpson优势度指数均最低, 分别为0.014 89和0.016 50, Shannon指数均最高, 分别为6.312和5.695.研究表明, 黄海和渤海刺参养殖池塘中, 冬季沉积物细菌多样性均最高.

关键词：刺参、养殖池塘、16SrDNA、变形菌门

所属期刊栏目：30

分类号：Q954.4(动物学)

资助基金：国家海洋局科研项目201105007-2;辽宁省教育厅优秀人才支持计划项目LJQ2011073

在线出版日期：2015-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：143-148