菲律宾蛤仔RP2基因的克隆及组织表达分析

摘要：

采用反转录PCR(RT-PCR)与cDNA末端快速克隆(RACE)法首次从壳长为28 mm的菲律宾蛤仔Ruditapes philippinarum外套膜中克隆出RP2 基因(GenBank登录号: KF826881).结果表明: RP2 基因cDNA序列长度为1158 bp, 包括62 bp的5′端非编码区, 41 bp的3′端非编码区, 开放阅读框1053 bp, 编码350个氨基酸; 推导的氨基酸序列具有TBCC(57aa~175aa)和CARP(65aa~102aa)保守结构域, 并为非跨膜糖蛋白; 经Blast同源性比较表明, 菲律宾蛤仔RP2氨基酸序列与太平洋牡蛎Crassostrea gigas的相似性较高(56%), 与高等哺乳动物、 鸟类、 鱼类、 两栖类和节肢动物各模式动物之间的相似性为43% ~53%, 与非洲眼线虫Loa loa的相似性较低(33%); 利用实时定量PCR技术检测RP2基因在菲律宾蛤仔不同组织中的表达, 结果显示, RP2基因在菲律宾蛤仔雄性性腺中表达量最高, 在鳃、 水管和外套膜组织中次之, 在斧足和闭壳肌中表达量极少, 在雌性性腺中无表达.研究表明, RP2基因在菲律宾蛤仔各组织中的表达较为广泛, 但不同组织的表达量存在明显差异, 本研究结果可为无脊椎动物RP2基因的结构及其功能研究提供基础数据.

关键词：菲律宾蛤仔、视网膜色素变性基因2、分子克隆、组织表达分析

所属期刊栏目：30

分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：国家现代农业产业技术体系建设专项CARS-48

在线出版日期：2015-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：132-137