双齿围沙蚕消化道共栖微生物菌群多样性的PCR-DGGE分析

摘要：

将采自青岛市沿海潮间带的双齿围沙蚕Perinereis aibuhitensis(体质量为4～5 g)置于无菌海水中暂养24h后,分别从5条双齿围沙蚕消化道中提取微生物基因组总DNA,应用细菌16S rDNA通用引物341f/534r进行细菌16S rDNA基因V3高变异区的PCR扩增,再将PCR产物进行变性梯度凝胶电泳(DG GE),从而获得样品消化道共栖微生物群落特征的DNA指纹图谱.通过对指纹图谱半定量分析发现,采集的双齿围沙蚕消化道共栖微生物菌群多样性丰富,优势条带明显,不同个体间既存在共同的微生物种属,也有各自特异的种属.其中存在一条共同的优势条带,但优势条带含量存在个体间差异.分别对DGGE指纹图谱中公共条带序列进行测序比对,结果表明,产丙酸菌属Propwnigenium分别为5个样品中的优势菌群,假交替单胞菌属Pseudoalteromonas广泛分布于双齿围沙蚕消化道中.研究表明,基于16S rDNA的PCR-DGGE图谱技术是分析双齿围沙蚕及其他海洋沉积食性无脊椎动物消化道微生物菌群结构较为有效的手段.

关键词：双齿围沙蚕、消化道、微生物、PCR-DGGE技术

所属期刊栏目：28

分类号：Q959;S94(动物学)

资助基金：国家"863"计划项目2006AA10Z410;国家海洋公益性行业科研专项200805069,201305002

在线出版日期：2013-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：413-417