HIV全序列中重复序列的研究

摘要：

文章统计了HIV全序列中所有不同长度的重复序列,并分析了其重复序列的AT/GC含量。研究发现：（1）重复序列出现的次数n与出现次数为n的重复序列总数N（n）之间存在power-law关系,这表明在HIV全序列中,只有少数重复序列会出现很多次,大部分重复序列只会出现少数几次;（2）HIV全序列中的AT含量高于GC含量,并且对于不同长度K的重复序列,100%AT含量的重复序列总是多于100%GC含量的重复序列,最长的100%AT含量的重复序列比100%GC含量的重复序列要长,这表明HIV全序列在进化过程中可能经受了更多的AT压力。通过对HIV全序列中的重复序列的分析,进一步讨论HIV进化历程及特点。

关键词：HIV、重复序列、power-law关系

所属期刊栏目：14

分类号：R51(传染病)

资助基金：艾滋病病毒进化历程及其潜伏期的研究T32581

在线出版日期：2012-07-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：131-133