大豆灰斑病菌Race 15的全基因组测序分析

摘要：

大豆灰斑病菌新小种Race 15具有强致病力和明显的生理分化现象,可导致传统抗病大豆品种的抗性丧失.为在基因组水平解析其致病机理,本研究对Race 15菌株进行全基因组测序和基因功能注释,并分析其毒力相关基因的代谢途径.结果表明:大豆灰斑病菌Race 15的全基因组de novo测序共产生601 794个PacBio读数,得到6 038 283 778 bp数据,经过组装得到12个contigs,N50长度为4.9 Mb,组装后得到的总序列长度为40.12 Mb.共预测到12 607个编码基因,基因密度约314个.Mb-1,预测得到了 200个tRNA,2个sRNA和13个snRNA.共有680个基因在病原与宿主互作数据库中注释,340个基因在碳水化合物酶数据库中注释,777个基因预测为次生代谢物相关基因,此外还有766个基因预测为分泌蛋白.这些与毒力相关的致病基因主要涉及细胞壁分解酶、真菌的形态构成、毒素和色素生物合成等.

关键词：大豆灰斑病;Race 15;全基因组测序;基因功能注释;毒力相关基因

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资助基金：黑龙江省应用技术研究;开发计划;财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系建设专项;农业科技创新跨越工程;黑龙江省自然科学基金

在线出版日期：2021-09-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：466-475