大豆耐涝bHLH转录因子筛选及生物信息学分析

摘要：

为研究大豆bHLH转录因子与涝害响应相关性,为大豆耐涝性研究提供理论基础,本研究对强耐涝性品种齐黄34进行没顶淹水处理,分析转录组测序结果,筛选差异表达的bHLH转录因子并对其进行生物信息学分析,采用荧光定量PCR方法验证主要差异表达bHLH转录因子编码基因的表达情况,并通过生物信息学方法分析基因结构和互作蛋白.结果 显示:涝害胁迫下共发现7个差异表达的bHLH转录因子,它们的同源性并不高,属于不同类型的bHLH.主要差异表达bHLH基因GmbHLH25-15(Glyma.15 G06680)的表达量变化情况与转录组数据趋势一致,呈现下调表达.预测到10个蛋白可与该蛋白互作,互作蛋白都是铵转运蛋白,其中4个蛋白编码基因的表达量在转录组测序结果中呈现显著性差异.推测在无氧条件下,GmbHLH25-15可能通过调控铵转运蛋白进而调节铵态氮的吸收来供给自身营养,进而抵御涝害胁迫.

关键词：大豆、耐涝、转录组、bHLH转录因子、GmbHLH25-15、铵转运蛋白

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资助基金：2020年海南省省属科研院所技术创新专项;2019年海南省基础与应用基础研究计划自然科学领域高层次人才项目

在线出版日期：2021-06-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：319-326