大豆Whirly基因家族的鉴定和表达分析

摘要：

Whirly家族是一类植物特异的转录因子,它们能与单链DNA分子结合,无论在细胞核还是在细胞器内都有着广泛而复杂的生物学功能.然而,目前还没有关于大豆Whirly基因的研究报道.本研究首次在全基因组水平鉴定和综合描述大豆Whirly基因家族成员,以期为它们的后续功能研究提供理论基础.该研究在大豆基因组中鉴定到了7个Whirly基因,并对其理化性质、亚细胞定位、进化关系、基因结构、蛋白基序组成、三维结构和基因表达模式等进行综合分析.根据它们的进化关系、基因结构和蛋白基序组成,将其分为两大类.蛋白三维结构分析结果表明,GmWHY5蛋白由于N端的缺失,缺少了β1-4和α1,与其它大豆Whirly蛋白结构差异很大.利用已公布的转录组数据进一步研究了大豆Whirly基因的表达谱,结果显示其组织和胁迫表达模式差异很大.例如GmWHY1、Gn WHY2、GmWHY6和GmWHY7的表达水平明显高于Gm WHY3、GmWHY4和GmWHY5.总之,这些发现将为大豆Whirly基因家族的研究提供重要的资源,并为进一步阐明其分子机制奠定基础.

关键词：大豆、Whirly基因家族、基因表达、干旱、盐害

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资助基金：中国博士后基金2017M622751;广东省自然科学基金2018A030310455;深圳孔雀创新团队基金KQTD2017032715165926;广东省生物学特色重点学科专项经费

在线出版日期：2019-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：204-211