大豆Argonaute4的生物信息学分析

摘要：

在RNA介导的DNA甲基化途径(RNA-directed DNA methylation pathway)中,Argonaute4(AGO4)蛋白是DNA被甲基化修饰的关键蛋白.研究大豆中Argonaute4蛋白能够为大豆甲基化研究奠定基础,本研究参考NCBI、Phyto-zome、UniProt KB等网站及数据库,对拟南芥的AGO4基因进行同源性分析,确定了大豆中AGO4蛋白及其基因序列,并对其进行分析预测.研究发现,大豆中AGO4包括3个基因GmA GO4A、GmAGO4、GmAGO4C,它们的一级结构、二级结构及理化性质都很相似,三级结构有差异,大豆AGO4C与拟南芥AGO4结构更相似.在302个野生大豆品系中对GmAGO4的3个基因的外显子进行核酸及蛋白序列的分析,发现一些大豆品系的蛋白质由于突变三维结构发生了变化.对大豆中AGO4及其参与的甲基化途径的研究具有指导意义.

关键词：大豆、AGO4、生物信息学、DNA甲基化

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资助基金：中央高校基本科研业务费专项资金项目2572017DA06,2572014CA21

在线出版日期：2019-03-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：25-34