菜用大豆蔗糖转运蛋白生物信息学分析

摘要：

为揭示菜用大豆SUT基因的结构特点,并为提高其表达活性提供理论依据,利用RT-PCR技术克隆菜用大豆SUT基因,长度为1 634 bp,编码区1 566 bp,编码一个含有521个氨基酸残基的多肽.生物信息学分析表明,SUT理论等电点9.33,理论分子量55.19 kD,是疏水性蛋白.SOMPA分析表明,SUT各个氨基酸残基对应的二级结构为α螺旋45.11％、β折叠14.20％、无规则卷曲36.47％和β转角4.22％;氨基酸序列和结构分析显示SUT蛋白包含1个保守区,即MFS2 domain和12个跨膜区.SignalP分析表明该蛋白没有信号肽.系统进化树分析表明菜用大豆GmSUT蛋白与绿豆(Vignaradiata var.radiata)的亲缘关系最近,同源性达93.28％.将该蛋白与拟南芥的9个SUC蛋白比对表明GmSUT与AtSUC2的亲缘关系最近,属于SUT1亚族.

关键词：菜用大豆、蔗糖转运蛋白、生物信息学分析、GmSUT基因

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资助基金：福建省属公益类科研院所基本科研专项2016R1025-6,2018R1026-1;福建省科技重大专项2015NZ0002-3;福建省农业科学院科技创新团队资助项目STIT2017-2-6

在线出版日期：2018-12-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：866-870