PEG模拟干旱胁迫下野生大豆转录组分析

摘要：

为研究耐旱型野生大豆在干旱胁迫下基因表达谱的变化,从备选野生大豆材料中筛选抗旱性强的野生大豆品种,同时探讨最适PEG胁迫浓度,而后以野生大豆永46为试验材料,利用RNA-seq技术对20％ PEG6000处理不同时间的叶片进行基因表达谱差异分析.结果显示:获得39 183个序列信息,其中各时期共有序列27 875个.随干旱胁迫时间延长,差异表达基因数量发生变化,胁迫12 h达到最多.根据GO功能分析可将序列大致分为分子功能、细胞成分和生物学过程三大类,其差异表达基因广泛涉及糖、脂类、蛋白质和核酸等生物大分子代谢、能量代谢以及次生代谢过程.在KEGG数据库中,依据代谢途径可将其定位在127个分支,包括植物-病原体互作、植物激素信号转导、RNA降解、ABC转运蛋白等,其中植物激素信号转导途径在不同时间处理下的变化都显著.转录因子分析发现在于旱胁迫下变化明显的转录因子家族包括MYB、bHLH、AP2\EREBP、WRKY和NAC等.对4个不同功能基因干旱胁迫后不同时间的表达量进行荧光定量分析,其变化趋势与转录组数据相同.

关键词：野生大豆、RNA-seq、干旱胁迫、转录组

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资助基金：转基因生物新品种培育科技重大专项2014ZX0800404B;河北省自然科学基金C2016407100,C2014407051;河北省研究生创新资助项目CXZZSS2018148

在线出版日期：2018-11-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：681-689