大豆GmIDD及其同源基因的生物信息学分析及功能预测

摘要：

利用NCBI和Phytozome数据库进行GmIDD基因的同源基因检索,获取该基因在大豆不同染色体中5个拷贝的序列信息.通过对功能结构域的分析结果显示GmIDD基因5个拷贝均含有2个C2 H2型(72～92 aa、114～142 aa)、2个C2HC型(149～169 aa、176～ 195 aa)锌指结构域.GmIDD基因cDNA序列全长为1 227 bp,编码408个氨基酸.系统进化树分析结果显示GmIDD基因5个拷贝中除了Glyma.14g10940和Glyma.17G228000外,其它IDD蛋白间进化距离较远,表明不同大豆IDD基因在功能上可能存在一定差异.长短日照处理下GmIDD表达量的分析结果显示GmIDD基因受短日照诱导表达,因此推测GmIDD可能参与大豆开花的调控过程.

关键词：大豆、GmIDD基因、锌指结构域、短日照

所属期刊栏目：36

分类号：S565.1(经济作物)

资助基金：黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划UNPYSCT-2015003;国家重点研发计划“七大农作物育种”重点专项2016YFD0101005;转基因生物新品种培育科技重大专项2016ZX08004-005;黑龙江省自然科学基金C2015009;东北农业大学“学术骨干”16XG03;东北农业大学2016年大学生SIPT计划201610224141;“十二五”农村领域国家科技计划课题2013AA102602

在线出版日期：2017-08-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：525-530