大豆GmST1基因的生物信息学分析

摘要：

磺基转移酶(sulfotransferase,SULT)基因是一个基因超家族.对大豆磺基转移酶基因GmST1(Glyma.13G191400)进行基于生物信息学的基因结构分析与功能预测,结果表明:GmST1(Williams82)基因序列全长1 439 bp,CDS区长1 035 bp,编码344个氨基酸.通过序列比对,分析出在感病Williams 82和抗病品种东农93-046中,GmST1序列存在着非同义SNP,导致氨基酸改变.利用PlantCARE分析启动子元件,发现在基因启动子序列中含有多个与光诱导、生长素、水杨酸、干旱等相关的元件.在BAR数据库中分析了GmST1的拟南芥同源基因在不同逆境胁迫条件下基因表达情况,表明该基因表达具有组织表达特异性,参与盐胁迫、干旱胁迫和抗病等相关反应.

关键词：大豆、GmST1、磺基转移酶、蛋白质结构分析、功能预测

所属期刊栏目：35

分类号：S565.1(经济作物)

资助基金：国家现代农业产业技术体系CARS-04-PS04;国家自然科学基金31301339;黑龙江省教育厅科学技术研究项目12541049;黑龙江省普通高等学校新世纪优秀人才培养计划1253-NCET-005.

在线出版日期：2016-06-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：394-401