大豆基因组WRKY31同源基因的生物信息学分析

摘要：

WRKY转录因子是一类参与多种生物和非生物胁迫的诱导性转录调控因子,在植物进化上高度保守.通过克隆大豆WKY31基因全长和生物信息学分析,发现WRKY31在大豆基因组中存在3个同源基因,分别位于第6、12和13号染色体上;WRKY31蛋白含有1个WRKY结构域(343 ～419 aa)和C2H2型锌指结构,属于第二类WRKY基因.RT-PCR分析表明,Gm WRKY31在大豆的叶、花、豆荚、根、根瘤中的组织内均有表达,且在花中表达量最高,豆荚中最低.通过MEGA 5.0软件分析,大豆和芸豆WRKY蛋白亲缘关系更近,位于同一分支上,而它的2个拷贝Glyma06g46420.2和Glyma12g10350.1位于另一个分支上,亲缘关系较近.蛋白结构及功能预测表明WRKY31是一类转录因子,参与胁迫反应;系统进化分析表明其基因在进化过程中功能上发生了重大分化.

关键词：大豆、WRKY31、胁迫、WRKY结构域、系统进化

所属期刊栏目：33

分类号：S565.1(经济作物)

资助基金：国家“十二五”科技支撑计划2011BAD35B06-1;现代农业产业技术体系CARS-04-PS04;国家重点基础研究发展计划“973计划”前期项目2012CB126311;国家自然基金31201227,31301339;中国博士后项目20110491024;黑龙江省博士后项目LBH11220,LBH-TZ1210;黑龙江省教育厅科学技术研究项目12541049;黑龙江省教育厅骨干教师项目1252G014;黑龙江省教育厅新世纪项目优秀人才资助项目1253-NCET-005;教育部博士点项目20122325120012;东北农业大学博士后启动金项目2012RCB11;大豆生物学教育部重点实验室开放基金项目SB12A05.

在线出版日期：2014-11-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：642-647