大豆DNA去甲基化酶IDM1基因5'调控区生物信息学分析

摘要：

利用生物信息学方法分析了IDM1基因在大豆中的存在状况及其5'调控区的启动子序列、甲基化位点及转录因子结合位点的分布情况.结果表明:IDM1基因在大豆中存在2个拷贝Glyma12g35760和Glyma 13 g34641,并且在表达时存在选择性剪接.对5'端的-2 000 ～200 bp序列分析发现,Glyma12g35760存在1段可能的启动子序列,1个CpG岛,大小为133 bp,位于495 ～627核酸序列之间,存在5个可能的转录因子结合位点,转录因子有SBF-1和athb-1两种;Glyma13g34641存在8段可能的启动子序列,无CpG岛,存在6个可能的转录因子结合位点,转录因子有P,SBF-1,MYB.Ph.该分析结果可为IDM1基因在大豆中的试验研究提供有价值的参考.

关键词：大豆、DNA去甲基化酶、IDM1、生物信息学

所属期刊栏目：33

分类号：S565.1(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金31201163;黑龙江省教育厅科学技术研究项目12521381;国家级大学生创业训练计划项目201310223001.

在线出版日期：2014-09-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：483-487