大豆基因组GmGAI同源基因的生物信息学分析

摘要：

利用Phytozome数据库、NCBI站和MEGA4.0、ClustalX软件对大豆(Glycine max)基因组中GAI(GA insensitive)同源基因进行生物信息学分析,发现大豆GAI基因有7个拷贝,都不含有内含子,分别分布于第4、5、6、8、10、11和18号染色体上,它们都属于GRAS家族,都存在DELLA (34-106)和GRAS(158-513)2个结构域.氨基酸序列比对和系统进化树分析表明,大豆GAI的7个拷贝进化距离并不是最近的,而是分别有与之最近的其他物种,推测大豆GAI的7个拷贝在进化的过程中功能上发生了一些变化,对植物的生长发育可能会产生不同的影响.

关键词：大豆、GAI基因、DELLA结构域、GRAS结构域

所属期刊栏目：31

分类号：S565.1(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金31101169,30971810;转基因生物新品种培育科技重大专项2011ZX08004-005

在线出版日期：2013-01-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：869-873,877