大豆TCP转录因子家族结构域分析及功能预测

摘要：

利用已知的拟南芥TCP基因和大豆基因组数据库,通过生物信息学方法,鉴定并获得了大豆TCP家族基因序列,基因定位信息.共鉴定大豆TCP基因54个,分布在大豆除14号染色体外的其他19条染色体上.对54个基因进行进化和聚类分析及功能结构域的分析,发现全部具有高度保守的TCP结构域.根据结构域差异和系统发育分析的结果,将大豆TCP转录因子家族分成2个TCP亚家族.以生物信息学手段和已有的其他物种的TCP基因进行了比较分析,大豆TCP基因占总数的3.5％,与拟南芥同源基因比较,序列长度存在相似性.对启动子元件分析显示,TCP基因含有大量与在子叶、根、茎处大量表达有关的元件及对分生组织有作用的元件.

关键词：大豆、TCP转录因子、结构域分析、功能预测

所属期刊栏目：31

分类号：S565.1(经济作物)

资助基金：抗除草剂转基因大豆新品种培育项目2011ZX08004-001-06;现代农业产业体系资助项目CARS-04-02A;黑龙江省普通高等学校新世纪优秀人才培养计划1252-NCET-004

在线出版日期：2012-12-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：707-713,717