大豆胞囊线虫病抗性相关AP2/EREBP转录因子生物信息学分析

摘要：

AP2/EREBP转录因子家族在植物应对逆境胁迫时发挥重要作用,为进一步了解大豆胞囊线虫病3号生理小种抗性相关AP2/EREBP家族转录因子生物学功能,研究利用"东农L-10"转录组测序结果,筛选得到14个与抗性相关AP2/EREBP转录因子序列,并对其开展在线生物信息学预测和分析.结果表明,14个转录因子多数为酸性等电点,均属于亲水性蛋白;通过与拟南芥AP2/EREBP转录因子作多序列比对和系谱进化树分析可知,AP2/EREBP转录因子根据其保守结构域特点分为AP2、ERF和DREB等3个亚族,且可分为B3、B5、A2和A5亚类.亚细胞定位预测结果显示AP2/EREBP转录因子发挥重要作用的位置依次为细胞核、线粒体、叶绿体;蛋白质二级结构中氨基酸序列以无规则卷曲为主要组成,α-螺旋次之,β-折叠和β-转角则散布于蛋白质序列中,同一亚族蛋白质三级结构之间无明显差异,而不同亚族之间差异显著,表明大豆胞囊线虫病相关AP2/EREBP转录因子在遗传进化过程中高度保守,其结构和功能可能具有相似性.

关键词：大豆胞囊线虫、AP2/EREBP、转录因子、生物信息学

所属期刊栏目：51

分类号：S565.1(经济作物)

资助基金：黑龙江省杰出青年基金项目;国家自然科学基金面上项目;国家科技重大专项和重点研发项目课题省级资助项目;黑龙江省博士后项目;国家重点研发计划项目

在线出版日期：2020-09-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1-8,73