大豆GmWRI1a基因克隆及生物信息学分析

摘要：

利用Phytozome数据库、NCBI网站等软件对大豆(Glycine max)基因组中WRI1同源基因进行生物信息学分析,发现大豆WRI1转录因子有2个拷贝,分布在第8和15号染色体上.以大豆未成熟种子cDNA为模板,克隆15号染色体WRI1转录因子的cDNA全长序列,命名为GmWRI1a.应用生物学软件发现,GmWRI1a蛋白含有2个AP2/EREBP结构域(60-225).进化树分析表明,GmWRI1a包含在第一个分支里,与AtWRI1距离较近,推断其与AtWRI1属于同源基因,具有相似的功能.对与GmWRI1a蛋白存在相互作用的蛋白进行预测分析,发现与其相互作用的蛋白多数参与糖降解或质体脂肪酸合成,结果表明,GmWRI1a转录因子可能在控制种子发育中时从糖到油的碳流动中起重要作用.

关键词：大豆、GmWRI1a基因、生物信息学、转录因子、合油量

所属期刊栏目：44

分类号：S565.1(经济作物)

资助基金：黑龙江省教育厅科学技术研究项目11551046

在线出版日期：2013-11-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：11-16