柳树株型调控CCO基因家族全基因组鉴定及表达模式

摘要：

为研究柳树的株型调控机理,分析了欧洲红皮柳(Salix purpurea)类胡萝卜素裂解氧化酶(CCO)基因家族,对其进行全基因组鉴定和表达谱分析.在biolinux系统中,通过生物信息学方法,对其理化性质、基因结构、进化特性、染色体定位和启动子元件等进行了分析.结果表明:筛选得到 15 个红皮柳CCO基因家族成员,系统进化树分析将该基因家族中的 15 个成员分成 5 个亚家族,无NCED5、NCED9 亚类.进化过程中有 4 对是由基因串联复制事件演化而来,其他 5 对是由于基因组的片段复制事件.分析了启动子区域相关的胁迫响应元件和激素响应元件,外源激素处理灌木柳发现CCD7 表达受抑制,SpCCD8 在茎段中与赤霉素处理表型呈正相关,为分枝调控基因.

关键词：欧洲红皮柳、CCO基因家族、株型调控、生物信息学分析、表达模式

所属期刊栏目：51

分类号：S792.12(森林树种)

资助基金：江苏省林业科学研究院自主科研项目;国家林业;草原局重点计划项目

在线出版日期：2023-07-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：46-52