柳叶芹叶绿体基因组组装与序列特征

摘要：

以2020年5月31日采自黑龙江省伊春市的柳叶芹(Czernaevia laevigata turcz.)为试验材料,利用十六烷基三甲基溴化铵法(CTAB)提取基因组DNA,采用Illumina NovaSeq平台进行高通量测序,得到柳叶芹完整的叶绿体基因组序列,分析柳叶芹叶绿体基因组组装、序列特征、系统发育.结果表明:柳叶芹叶绿体基因组总长度146161 bp,包括1个大单拷贝区长度为93538 bp、1个小单拷贝区长度为17779 bp,由2个反向重复序列分别分隔,每个反向重复序列为17422 bp.对柳叶芹叶绿体全基因组共鉴定出133个基因.系统发育分析表明,柳叶芹与疏叶当归有密切的亲缘关系.柳叶芹的叶绿体基因组序列,为研究伞形科其他植物提供了较为详细、完善的资料,为该物种鉴定以及群体和个体水平的遗传差异分析提供了新的方法.

关键词：柳叶芹、叶绿体基因组、系统发育、伞形科

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分类号：Q949.763.3;Q943.2(植物学)

资助基金：中央本级重大增减支项目;中药制药过程新技术国家重点实验室开放基金项目

在线出版日期：2022-04-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：49-52,99