基于SSR分析的富民枳样本量对其遗传多样性指标的影响

摘要：

为了对极小种群野生植物富民枳(Poncirus polyandra)采取合理有效的保护措施,采用SSR分子标记作为遗传完整性检测标记,研究不同梯度的有效样本量对微卫星分析中遗传多样性指标的影响.本研究利用5对SSR引物,对65份富民枳种质材料进行遗传完整性检测,并对富民枳种植资源遗传多样性的微卫星数据进行分析.结果表明:随着有效样本量的增加,有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、多态性信息量和Shannon信息指数等遗传指标均随之增加,有效样本量与遗传多样性指标呈显著正相关.当以有效等位基因数、多态性信息量(PI,C)和Shannon多样性指数等来衡量时,有效样本量29株为曲线的拐点,此时代表了95％以上的遗传多样性水平;而以观测杂合度和期望杂合度来衡量时,有效样本量为25株时,便达到了该总体遗传多样性水平的95％以上.综合分析表明,富民枳的有效样本量以25～29株较为合适,目前富民枳的种质保存是合理有效的.

关键词：极小种群野生植物、富民枳(Poncirus polyandra)、遗传完整性、有效样本量、遗传多样性指标

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分类号：S722.8(造林学、林木育种及造林技术)

资助基金：国家自然科学基金项目31460119和31660164;科技基础资源调查专项2017FY100102

在线出版日期：2017-10-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：35-39,44