基于转录组学测序的长白落叶松材性表达基因1）

摘要：

基于边合成边测序（ Sequencing By Synthesis ，SBS）技术，使用Illumina HiSeq2500高通量测序平台对长白落叶松cDNA文库进行测序。共获得非重复序列基因58683条，总长度为55283938 bp。将得到的转录本使用BLAST软件将非重复序列基因序列与NR、Swiss－Prot、GO、COG、KEGG数据库比对，通过选择BLAST参数E－value不大于10－5，最终获得29350个有注释信息的基因序列，其中19292个转录本注释GO编号，有9112个转录本在COG数据库中被注释并分为25个功能分类，同时注释到120条KEGG代谢途径。在得到注释的转录本中搜索到木质素相关基因共68条，其中与木质素合成相关基因29条，与木质素分解代谢相关基因27条；找到了147条纤维素相关基因，其中与纤维素合成相关基因103条，与纤维素分解代谢相关基因44条。

关键词：长白落叶松、转录组、高通量测序、材性基因

分类号：S791.225(森林树种)

资助基金：1国家高技术研究发展计划863计划2013AA102704。

在线出版日期：2016-04-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：8-12