基于454测序的碧桃花瓣组织转录组核苷酸变异1）

摘要：

通过对碧桃花瓣组织进行转录组测序，获得1556684条序列，平均读长446 bp，共计695．34 Mb数据，其中1492289条高质量序列经拼接后得到22762个重叠群。以拼接后的重叠群作为参考序列，利用SNP／InDel分析软件检测碧桃花瓣组织转录组中的核苷酸变异位点，共得到9836个SNP和1550个InDel位点。在SNP位点中，转换占62．55％、颠换占37．45％，A／G的变异最为丰富，C／G的变异最少。在InDel位点中，有34．71％的位点为单核苷酸插入、缺失突变。

关键词：碧桃、转录组测序、单核苷酸多态性、插入缺失长度多态性

分类号：S662.1(果树园艺)

资助基金：1国家自然科学基金31270711、31400564;江苏省自然科学基金BK20130968;江苏省南方现代林业协同创新项目，江苏高校优势学科建设工程PAPD资助。

在线出版日期：2015-01-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：85-88