基于功能网络信息传播预测疾病-miRNAs的关联

摘要：

为了快速发现与疾病关联的miRNA,基于功能网络信息传播,提出PMBP算法用于改进随机游走法,使用留一交叉验证评估了算法性能,最后进行案例分析.实验结果表明:对于尚未发现关联miRNA的疾病,随机游走法是失效的,而PMBP以疾病相似性作为先验信息,能够有效预测;对于已经关联miRNA的疾病,PMBP提高了预测性能,AUC值为0.866.对乳腺癌进行案例分析,预测的前50个miRNAs都被证实与乳腺癌相关,体现了PMBP算法的有效性.

关键词：功能网络、疾病网络、网络传播、随机游走、miRNA预测

所属期刊栏目：39

分类号：Q811.4(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家自然科学基金资助项目61372014

在线出版日期：2018-04-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：325-328,344