不同16S rDNA靶序列PCR-DGGE分析油页岩细菌多样性

摘要：

为全面了解油页岩细菌群落组成结构,同时筛选出适于油页岩PCR-DGGE的最佳引物,采用改进SDS高盐提取法,提取抚顺西露天矿油页岩微生物总DNA,并用968F/1401R,338F/518R,341 F/907R和1055F/1406R,对16S rDNA V6-V8,V3,V8和V9区进行PCR-DGGE分析.结果表明,4组引物均能较好扩增出目的基因,但不同靶序列对多样性检出有显著影响(P ＜0.001);与其他引物相比,968F/1401R和338F/518R获得的指纹图谱物种丰富度更高,检出细菌类群更丰富,较适合油页岩样品.油页岩细菌群落组成较简单,优势细菌包括不动杆菌属、假单胞菌属和埃希氏菌属,同时还有假单胞菌目和肠杆菌目尚未被鉴定的一些种类.

关键词：油页岩、16S rDNA、PCR-DGGE、细菌多样性、靶序列

所属期刊栏目：35

分类号：TP274(自动化技术及设备)

资助基金：国家自然科学基金资助项目51204055;中国博士后科学基金资助项目20100481205

在线出版日期：2015-07-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1033-1038