10.3321/j.issn:1005-3026.2008.10.006
粗糙集算法在预测RNA保守功能二级结构中的应用
提出了一种预测RNA保守功能二级结构的粗糙集算法.使用粗糙集工具Rosetta软件,在保守结构预测过程的数据挖掘模块中,应用经过整理和离散化的RNA备择碱基对数据生成规则确定出将要出现在同源RNA序列的保守二级结构中的碱基对.将此算法应用在对爱滋病病原体HIV病毒RNA中REV应答元件单元的保守二级结构预测的结果表明,与传统的非数据挖掘算法相比,使用了这种机器学习算法的粗糙集预测方法,使得保守功能结构与野生型结构更加相似,重要的功能结构分支更加清晰明确.
RNA二级结构、粗糙集、REV应答元件、保守结构预测、HIV、Rosetta
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TP391(计算技术、计算机技术)
辽宁省科学技术基金资助项目002010
2008-12-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共4页
1389-1392