人与十种寄生虫HMGB1序列比对分析

摘要：

目的:确定人与寄生虫高迁移率族蛋白B1 (HMGB1)的相似性关系.方法:运用分子生物学工具软件Generous检索NCBI数据库HMGB1氨基酸序列,比对分析寄生原虫、寄生丝虫和寄生吸虫的序列相似性以及氨基酸组成,比对分析人HMGB1炎症相关序列与10种寄生虫HMGB1的相似性.结果:3种寄生原虫、3种丝虫和4种吸虫的HMGB1序列位点一致性分别为69.2％、93.1％、68.3％;人HMGB1炎症相关序列与寄生虫HMGBl序列位点一致性50.7％.结论:人与寄生虫HMGBl序列同源,炎症相关序列与寄生虫HMGBl序列一致,人与寄生虫HMGBl促炎症作用可能存在构象和通路差异.

关键词：高迁移率族蛋白B1、序列比对、炎症、Generous

所属期刊栏目：28

分类号：R582.7(内分泌腺疾病及代谢病)

资助基金：山西省自然基金项目2008011073-4;山西省教育厅2013高等学校131领军人才工程项目

在线出版日期：2015-01-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：321-324