基于全基因组重测序的白化茶树mSNP标记开发及验证

摘要：

为探究白化茶树遗传变异信息及mSNP液相芯片在茶树种质资源鉴定中的可行性,利用全基因组重测序对18份白化茶树资源进行遗传多样性分析和突变位点检测.结果表明,基于全基因组水平的SNP标记可将18份白化茶树资源分为3类,且基本呈现出具有亲缘关系或地理位置接近的资源聚在一起的趋势;对重测序数据进行功能注释后发现,在18份白化茶树资源中存在17056个共有非同义突变基因,其中14个叶绿素合成相关基因中存在98个错义突变位点.随后,基于前期获得的基因组变异信息开发了一套包含59个mSNP、222个SNP位点的液相芯片,利用该液相芯片检测13份茶树资源的基因型信息.结果表明,同一品种两两之间的遗传相似度在92％～98％,不同品种间的遗传相似度则在84％以下,表明该芯片可对18份白化茶树资源进行准确鉴别,研究结果可为mSNP液相芯片在茶树种质资源鉴定、分子标记辅助育种等方面的应用奠定基础.

关键词：茶树、mSNP分子标记、靶向测序基因型检测、遗传多样性、全基因组重测序

所属期刊栏目：43

分类号：S571.1;S326

资助基金：国家重点研发计划;浙江省农业茶树新品种选育重大科技专项子课题;中国农业科学院茶叶研究所基本科研业务费;浙江省自然科学基金项目

在线出版日期：2023-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：27-39