茶树PPR基因家族全基因组鉴定及白化相关基因表达分析
三角状五肽(PPR)蛋白作为一类靶向定位于半自主细胞器的序列特异性RNA结合蛋白,在植物的生长发育过程中具有重要的作用.本研究基于茶树基因组数据,利用生物信息学方法对茶树CsPPR基因家族进行系统鉴定,并对其蛋白质理化性质、结构域保守性、亚细胞定位、基因结构、染色体定位与分布等进行了分析.结果表明,在茶树基因组数据中共鉴定到858个CsPPR基因,分属于P和PLS两个亚家族;结构域分析表明各个结构域在茶树中比较保守;亚细胞定位结果显示超过一半的CsPPR蛋白定位于叶绿体;基因结构分析表明茶树CsPPR基因家族中共有31％的CsPPR基因不具有内含子结构,并且家族成员在进化过程中发生过多次基因复制事件.另外,为探究茶树CsPPR基因家族在调控茶树白化相关基因表达过程中的作用,对正常叶色品种舒茶早和安吉黄茶等5个白化茶树品种进行转录组测序,共筛选到24个差异共表达CsPPR基因,并利用实时荧光定量PCR技术对其在不同品种和不同组织中的表达模式进行了分析,结果显示大多数CsPPR基因在新梢、成熟叶和茎中高表达,但在花和根中痕量表达.本研究结果可为茶树CsPPR家族成员的基因克隆和功能研究提供参考.
茶树、PPR基因家族、转录组、生物信息学、实时荧光定量PCR
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S571.1;Q946.84+1;Q939.1
中国农业科学院科技创新工程;现代农业产业技术体系;浙江省农业茶树新品种选育重大科技专项子课题;中国农业科学院茶叶研究所基本科研业务费
2021-04-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共14页
159-172
