基于nSSR和cpDNA序列的城步峒茶群体遗传多样性和结构研究

摘要：

采用简单重复序列标记(nSSR)与叶绿体DNA序列(cpDNA)分析技术,对城步峒茶群体进行了遗传多样性、遗传结构和遗传分化等研究.结果表明,15对nSSR引物在参试81份资源中共获得142个等位位点,平均每对引物9.47个,城步峒茶群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和Nei期望杂合度(Nei)分别为0.49、0.62和0.62,具有较高的遗传多样性.Structure分析将79份峒茶资源分成3个类群,但各类群的遗传背景较为复杂,没有明显的群体结构.F检验表明,城步峒茶群体的近交系数FIS为正值(FIS=0.1775),群体间的遗传分化系数FST较小(FST=0.0345),分化程度较低,基因流Nm较高(Nm=7.01).3对cpDNA引物分别获得了473 bp(rbcL)、704 bp(matK)和320 bp(psbH-trnA)的片段序列,变异位点占总位点的比例分别为0.42％、0.71％和1.25％.将3个序列依次拼接,共产生了9个单倍型,单倍型数由多到少的居群依次为TXZ(6)、DZC(4)、DPS(4)、TYS(3)、HJZ(2),群体的单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.732和0.00139.9个单倍型中,单倍型H1和H5处于进化网络图的中心节点上,并且包含资源数量最多,属于比较原始的单倍型.同时,nSSR和cpDNA的AMOVA分析结果基本一致,居群内的变异百分比分别达到96.69％和80.54％,城步峒茶的遗传变异主要存在于居群内.

关键词：茶树、城步峒茶、nSSR、cpDNA、遗传多样性、群体结构

所属期刊栏目：40

分类号：S571.1;S324

资助基金：国家自然科学基金;国家茶叶产业技术体系建设专项资金;湖南省农业科学院科技创新项目;湖南省科技重点研发计划

在线出版日期：2020-04-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：250-258