茶树儿茶素合成相关MYB转录因子生物信息学分析

摘要：

从茶树(Camellia sinensis)转录组数据库中获得6个与儿茶素合成相关的MYB转录因子,对其进行蛋白理化性质与结构功能预测、核定位信号和蛋白保守结构域分析,通过同源分析构建系统发育树.结果表明,与儿茶素合成相关的6个MYB蛋白都属于亲水性的非分泌蛋白,定位在叶绿体、线粒体和细胞核上,其空间结构主要是 α-螺旋和 β-转角;保守结构域的分析发现除了 comp159173_c0基因,其余5个都属于SANT超家族基因成员.系统进化树显示6个MYB蛋白形成4个分支,显示出各自间较远的亲缘关系.差异表达分析的结果进一步证实了6个MYB转录因子与儿茶素合成代谢的相关性.

关键词：儿茶素、MYB转录因子、生物信息学

所属期刊栏目：38

分类号：S571.1;Q946.8

资助基金：福建省教育厅中青年教师教育科研项目JAT170178;福建农林大学人才引进科研启动基金KXR15008A;国家自然科学基金31170651

在线出版日期：2018-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：162-173