10.3969/j.issn.1000-369X.2014.05.009
基于4300 DNA分析系统的茶树SSR发掘方法优化与建立
简单序列重复(Simple sequence repeats, SSR)在茶树遗传与育种研究中具有重要的作用,基于4300 DNA 分析系统的 SSR 发掘具有通量高、准确和灵敏等特点,已被用于许多物种的分子标记研究,但在茶树的相关研究中尚未见报道。本研究应用单因素试验和L9(34)正交设计试验对影响茶树SSR-PCR的主要参数进行优化,建立了适合于4300 DNA 分析系统的茶树 SSR-PCR 反应体系:1.0μL DNA(25 ng·μL-1),0.2μL M13F-F、0.2μL R和0.4μL IR-M13F,0.8μL dNTPs(25 mmol·L-1),1.0μL 10×Buffer(含Mg2+),0.1μL Ex-Taq 聚合酶(5 U·μL-1),无菌水定容至10μL。所有引物浓度均为1μmol·L-1。同时,本研究还证明,可以以自行配制的6.5%聚丙烯酰胺凝胶溶液(acry∶bis=29∶1)替代4300 DNA分析系统指定凝胶溶液,检测SSR位点。
茶树、4300 DNA分析系统、SSR-PCR
S571.1
国家星火计划重大项目2012GA710001;安徽省科技专项13Z03012
2014-11-03(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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