茶树cpDNA测序及基于cpDNA序列的山茶属植物亲缘关系研究

摘要：

叶绿体基因组在物种鉴定、系统进化分析及亲缘关系研究等领域应用前景广阔。本文应用 Illumina 高通量测序技术对龙井43（Camellia sinensis cv. Longjing 43）的叶绿体全基因组进行测序；利用叶绿体trnL-trnF序列研究茶树及其近缘植物的亲缘关系。结果表明，龙井43叶绿体基因组全长为157096 bp，反向互补重复区（Inverted repeat, IR）为26080 bp，小单拷贝区（Small single copy region, SSC）、大单拷贝区（Large single copy region, LSC）分别为18283 bp、86653 bp。共注释叶绿体基因133个，其中蛋白编码基因86个，rRNA基因8个，tRNA基因39个。对所选植物的trnL-trnF序列进行比对，序列长度变异范围为481~501 bp，序列最长为岔河大茶，最短为金花茶，基于此序列构建亲缘关系树，山茶属茶组植物聚成一个组。研究结果对茶树优良品种培育及山茶属植物亲缘关系的研究具有重要价值。

关键词：茶树、叶绿体基因组、高通量测序、亲缘关系

分类号：S571.1;S326

资助基金：国家茶叶产业技术体系项目CARS-23;国家自然科学基金项目30901159、31170624、31100504

在线出版日期：2014-09-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：371-380