SNaPshot技术检测茶树SNP研究

摘要：

为了提高茶树 SNPs 分型效率，促进 SNPs 在茶树遗传育种中的应用，研究了 SNaPshot 技术进行茶树SNPs分型的可行性。从实验室前期确证的SNPs中，选择10个作为目标SNPs；使用SNaPshot技术在不同的茶树品种中进行分型；然后，对分型结果进行比对和统计，以验证 SNaPshot 技术检测茶树 SNPs 的准确性、重复性以及在茶树遗传多样性分析等方面的可用性。结果发现，6个 SNPs分型结果与测序结果一致，准确率为60%；目标SNPs在龙井43及其重复实验中的分型结果完全一致；6个SNPs的等位基因数都是2，期望杂合度（He）介于0.37~0.52，观测杂合度（Ho）介于0.32~0.74，多态性信息含量（PIC）介于0.36~0.50；结果表明，SNaPshot技术对茶树SNPs的分型准确性高、重复性好，可以用于茶树遗传多样性分析以及茶树遗传图谱构建等方面的研究。

关键词：茶树、SNPs、SNaPshot、遗传多样性、遗传图谱

分类号：S571.1;Q52

资助基金：现代农业产业技术体系建设专项nycytx-23;浙江省自然科学基金X307603;浙江省茶产业技术创新战略联盟专项

在线出版日期：2014-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：180-187