10.3969/j.issn.1000-369X.2012.04.013
茶树EST-SNP分布特征及标记开发
对NCBI网上公开的12757条茶树ESTs序列进行聚类,成功构建了茶树的独立基因(Unigene)数据库,发现茶树的EST序列冗余率约为68.2%.初步建立了茶树EST-SNP标记开发体系,明确了茶树EST中SNP的分布规律,茶树编码区的SNP发生频率约为0.58%,平均200bp就有1个SNP位点,并进一步推算出茶树基因组DNA序列的杂合率约为0.38%,平均300个碱基就可能出现1个杂合位点.从237个多基因聚类簇中发现了818个SNP候选位点,设计了25对SNP引物进行DNA重测序验证,发现EST-SNP候选位点的多态检出率为75%.
茶树、表达序列标签、单核苷酸序列多态性
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S571.1;Q52
现代农业产业技术体系建设专项资金nycytx-23;浙江省自然科学基金X307603;浙江省茶产业技术创新战略联盟专项资金
2013-09-09(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共8页
369-376