10.3969/j.issn.1000-369X.2006.01.003
茶树EST-SSR的信息分析与标记建立
在1589条茶树EST中,共发掘出了281个EST-SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%,平均长度为33.06 bp,平均分布频率是1/2.61 kb.在茶树EST-SSR中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是AG/CT重复.设计了19对SSR引物,在对引物、dNTP、MgCl2的浓度及退火温度等参数进行测试后,建立了合适的PCR反应体系.以衍生绝大多数EST-SSR的龙井43 DNA为模板,对引物进行了筛选,有16对引物显示扩增,可用率为84.2%;进一步在10个茶树品种中进行多态性测试,显现出多态性的引物占可扩增引物的62.5%.本文研究结果证明了根据茶树EST建立SSR标记是有效、可行的.
茶树、EST、SSR信息、标记建立
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S571.1;Q523
2006-04-20(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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