靶向转化生长因子-βⅡ型受体核酸适配子结合位点预测及相关验证研究

摘要：

目的：预测转化生长因子-βⅡ型受体（T RβⅡ）胞外段蛋白与靶向适配子S58的结合位点，并在体外进行验证，证实S58的结构稳定性。方法通过适配子ssDNA序列建立其三维结构，在蛋白质数据库搜索受体蛋白 TRβⅡ胞外段的晶体结构，运用计算机辅助技术对两个分子进行对接实验，根据结果指导剪切优化适配子结构，分别用生物传感器技术及蛋白免疫印迹法验证其亲和力。结果核酸适配子ssDNA S58与 TRβⅡ胞外段蛋白结合的可信位点包括位点Ⅰ（T4、T5、G6、C7）、位点Ⅱ（G13、A14、T15、C16、G17、C18）、位点Ⅲ（T31、G32、T33、C34）及位点Ⅳ（G40、A41、T42、T43、T44、G45、G46）。S58与TRβⅡ胞外段蛋白的亲和力高，S58的α-平滑肌肌动蛋白（α-SMA）表达明显较DMEM 对照降低（P＜0．05），根据结果剪切适配子S58后得到优化后的ssDNA亲和力、α-SMA表达均不如S58。结论核酸适配子S58为受体蛋白TβRⅡ的高特异性分子，具有一定稳定性，任何结构的改变均会降低与TβRⅡ的亲和力。计算机辅助的分子对接技术成为一项探索分子间作用的重要手段，为医学基础研究提供了良好的理论依据。

关键词：转化生长因子-βⅡ、寡核苷酸类、分子对接、结合位点、生物传感器

分类号：R73;R57

资助基金：国家自然科学基金面上项目81170852。

在线出版日期：2014-04-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1034-1037