2012年贵州省风疹病毒分离株的基因特征分析

摘要：

目的：对2012年贵州省流行的风疹病毒进行鉴定，确定其基因型，并进行基因特征分析。方法采集2012年贵州省风疹爆发和散发疑似病例咽拭子标本，使用Vero/SLAM细胞进行病毒分离。经RT-PCR方法鉴定为阳性的风疹病毒分离株，使用RT-PCR方法扩增风疹病毒E1基因944个核苷酸片段，并对扩增产物进行序列测定和分析，与W HO 13个基因型的32个参考风疹病毒株的序列基于1E基因的739个核苷酸片段构建基因亲缘性关系树。结果贵州省首次成功分离到5株风疹病毒株，基因亲缘性关系树显示，该5株风疹病毒分离株均属1E基因型。5株风疹病毒分离株之间的核苷酸和氨基酸同源性分别为99．8％～100．0％和100．0％；与WHO 1E基因型参考株中国株（T14-CH-02）核苷酸和氨基酸同源性分别为98．7％～98．9％和100．0％；与WHO 1E基因型参考株马来西亚株（M1-MAL-01）核苷酸和氨基酸同源性分别为97．5％～97．6％和99．5％。结论2012年贵州省分离的风疹病毒是1E基因型，与目前我国其他省份流行的风疹病毒基因型一致。本研究为贵州省积累了风疹病毒分子流行病学基线数据。

关键词：风疹病毒、序列分析、1E基因型

分类号：R37;R71

资助基金：贵州省疾病预防控制中心科技基金资助项目2011-2-7。

在线出版日期：2013-12-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：3849-3851,3855