DNA甲基化数据分析方法和软件应用

摘要：

目的 分析DNA甲基化芯片实验过程质量控制方法 、数据统计分析要点及实验结果 的验证和数据的可视化处理.方法 利用文献、DNA甲基化实验数据探讨DNA甲基化研究中的方法 学.结果 DNA甲基化芯片初筛异常过程应多在步骤质量控制工作中,包括DNA片段化、免疫共沉淀阳性对照的选择、去除原始扫描噪音信号和数据均一化处理.DNA甲基化芯片的结果 可采用常用的甲基化特异性PCR(MSP)和甲基化测序PCR(BSP),引物设计软件包括Methprimer和Methyl Primer Express.DNA甲基化芯片分析数据的可视软件为Signal map;BSP结果 的可视化可采用Windows系统下的执行软件QUMA和BISMA.结论 DNA甲基化研究,应从多角度控制实验的设计和数据的产生及结果 的分析.

关键词：DNA甲基化、软件、质量控制、数据分析

所属期刊栏目：41

分类号：R73;S82

资助基金：重庆市生殖健康与出生缺陷重点实验室开放课题0801;重庆市科委项目CSCT2009BB5271

在线出版日期：2012-07-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1719-1721,1726