登革病毒中国株E基因重组的生物信息学分析

摘要：

目的:了解我国登革病毒(Dengue virus,DV)包膜蛋白基因(Envelope,E)重组的发生情况.方法:从GenBank收集共70个DV中国株的E基因序列,Clustal-W比对后,重组检测软件包RDP3检测E基因中可能存在的重组事件,并经Mega4构建系统发生树验证所检测的重组事件的可靠性和真实性.结果:DV-1型中E基因区存在3个重组事件,共4个重组子,分别是1995、1997、1999年和2004年分离的DV病毒株,在其它3个血清型的DV病毒株中没有检测到重组,也未检测到血清型间重组.结论:我国DV 1型血清型E基因区域存在基因重组.

关键词：RDP3、登革热、E基因、遗传重组

所属期刊栏目：37

分类号：R373.3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：重庆医科大学院青年教师科研基金资助项目0800280002

在线出版日期：2012-06-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：67-70