核苷酸序列测定法定量评价病毒相对适合度

摘要：

目的:评价核苷酸序列测定法定量检测病毒相对适合度的可靠性.方法:用RT-PCR法扩增此前筛选获得的Palivizumab逃逸株F基因片断(分别于F基因第816位和828位带有区别于原型株的遗传标志).RT-PCR产物经纯化、定量并调节至相同浓度,按不同比例混合后进行核苷酸序列测定.用ABI公司EDIT软件分析序列双峰部位不同RT-PCR产物所占比例,代表病毒适合度水平,用分子克隆法定量验证序列分析定量评估病毒相对适合度的可靠性.结果:按不同比例预混得RSV A2原型株和Palifizumab逃逸株(MP4和F212)分别在F基因第816位和828位出现双峰.峰高测定所获RT-PCR产物比例与预混比例十分接近.采用分子克隆法获得的RT-PCR产物比例亦与序列测定定量分析结果基本一致.结论:序列测定定量分析法评估病毒相对适合度(Relative fitness)结果稳定可靠,简便易行,适用于临床检测HIV等病毒感染性疾病耐药毒株是否出现及其适合度变化.

关键词：呼吸道合胞病毒、适合度、检测手段、核苷酸序列测定

所属期刊栏目：34

分类号：R373.1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金30471839,30800972

在线出版日期：2009-08-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：926-929