基于置换检验的两步基因特征选择算法

摘要：

针对目前大规模基因数据集中存在大量的噪声和冗余基因这一问题,提出了一种基于置换检验的两步基因特征选择算法.该算法首先采用方差分析过滤噪声基因,然后采用相关系数过滤冗余基因,最后结合置换检验的方法,可以高效、自主地处理大规模基因数据集.采用PAM(prediction analysis for micmarrays)分类器,在RSCTC2010 Discovery Challenge提供的12个竞赛数据集作基因特征选择与分类实验,实验结果表明,提出的算法能够选择高分辨、低冗余的基因子集,与目前其他基因特征选择算法相比,可以提高分类器性能.

关键词：基因微阵列、基因特征选择、置换检验

所属期刊栏目：24

分类号：TP311(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金61073146;中国与波兰政府间科技合作项目国科外字[2010]179号

在线出版日期：2012-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：483-489