白鹭基因组微卫星分布规律研究

摘要：

[目的]研究白鹭(Egretta garzetta)的全基因组微卫星分布规律.[方法]利用生物信息学方法对已报道的白鹭全基因组进行查询和分析.[结果]白鹭全基因组中1～6个碱基重复的微卫星有255 630个,序列总长度为4 282 844 bp,占全基因序列长度的0.37％.不同重复类型的微卫星中,单碱基的数量最多,有207 108个,占全部类型的81.0％;然后依次是二碱基、三碱基、四碱基、五碱基、六碱基,分别占全部类型的6.4％,5.3％,4.9％,2.0％和0.4％.A,C,AC,AT和AG是白鹭基因组微卫星序列中重复数量较多的拷贝类型,占全部重复类型的87.4％.在白鹭基因组中,按降序排列,重复类型出现次数超过1 000次的有17个,分别是T,A,AT,G,C,AC,GT,ATT,AAT,ATTT,AGG,AAAC,CCT,AAAT,CT,GTTT和AG,占全部微卫星数量的92.7％.[结论]研究结果对白鹭微卫星的筛选及深入研究提供了数据支持.

关键词：白鹭、微卫星、基因组、分布规律

所属期刊栏目：36

分类号：Q953(动物学)

资助基金：国家自然科学基金;重庆市自然科学基金;重庆市自然科学基金;重庆市留学人员回国创业创新支持计划;国家科研启动基金

在线出版日期：2019-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：66-71