多肽序列的结构特征与其免疫原性关系的研究

摘要：

拟建立Th细胞表位预测的自动化、程序化方法.从多肽序列的一级结构出发,将各氨基酸侧链看成一个整体即拟原子,并基于多肽序列中氨基酸侧链间距离和氨基酸侧链的电性特征,构建了能描述多肽序列结构特征的序列特征矢量,简称ζ矢量.选取文献中MHC限制性为14个Ad限制性和14个非Ad限制性多肽序列,分别定义为活性和非活性肽,并以之作为训练集来建立Th细胞表位预测的定量模型.为检验该预报系统的精确性,进行了随机抽样检验和交互检验,结果表明,该预报系统具有稳定性好、预测能力强的特点,该方法还可推广用于人的MHC Ⅰ、Ⅱ类表位的预测研究,可望在蛋白质抗原免疫识别、亚单位疫苗分子设计及研制中发挥重要作用.

关键词：表位预测、MHC限制性、拓扑特征、序列特征矢量

所属期刊栏目：17

分类号：Q7(分子生物学)

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：12-17