基于eDNA宏条形码技术的上海骨干河流鱼类多样性研究
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10.11870/cjlyzyyhj202307007

基于eDNA宏条形码技术的上海骨干河流鱼类多样性研究

引用
为了解淀浦河、川杨河、大治河、金汇港、龙泉港等5条上海市骨干人工河流鱼类物种多样性及群落结构状况,于2021年6月(夏季)和11月(秋季)经过水样采集、eDNA抽滤和提取、12SrRNA遗传标记扩增、高通量测序与生物信息分析等分析流程.结果显示,两次调查共从5条骨干河流的20个断面中检测到80种鱼类,排除10种因厨余废物流入河道而被检出的海洋种类,实际栖息的可能有70种,隶属于10目22科55属,包括国家Ⅱ级重点保护动物胭脂鱼(Myxocyprinus asiaticus)和5种外来物种.夏季和秋季检出鱼类分别为48种和62种,每条河流平均35.2种和44.0种.但20个断面夏季的Chao1指数和ACE指数均大于秋季均值,而Shannon指数和Simpson指数均值均小于秋季.夏、秋两季共同的优势种为刀鲚(Coilia nasus)、鲫(Carassius auratus)和鲤(Cyprinuscarpio).Jaccard相似性分析显示,断面间相似性最好的龙泉港表现为极相似,但表现最差的大治河也为中等相似.Cluster聚类和NMDS排序分析显示,5条河流可分为显著差异的3组,即龙泉港、金汇港和除Z1断面外的大治河各断面为组Ⅰ,川杨河和淀浦河各断面为组Ⅱ,Z1断面为组Ⅲ,刀鲚、鲫、大鳍鱊(Acheilognathus macropterus)是造成组间差异的主要分歧种.研究检出的鱼类物种数虽多于黄浦江干流已记录的物种数,但厨余废物流入河道也能被检出,可能存在一定的"假阳性"现象.尽管如此,eDNA宏条形码技术仍在城市河流鱼类多样性评估方面展现良好应用前景.

上海骨干人工河流、eDNA宏条形码、鱼类多样性、群落结构、空间差异

32

S932(水产资源)

国家重点研发计划;上海市生态环境局淀浦河等骨干河道鱼类多样性调查及水生态健康评估

2023-08-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共14页

1433-1446

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