基于16S rDNA序列的2株气单胞菌属细菌的分子鉴定

摘要：

对分高自患病鲫鱼的2株气单胞菌的16S rDNA序列进行PCR扩增并测定其核酸序列,通过NCBI的BLAST查找同源序列,应用MegAlign采用Jotun Hein、ClustalV以及CustalW 3种方法分别进行序列比对,并利用Mega4.0软件采用邻接法(N-J)、最小进化法(ME)、最大筒约法(MP)、非加权组平均法(UPGMA)构建系统发育树.3种序列比对结果显示,Aeromonas sp.T1与Aeromonas sp.T2序列具有较高的相似度,分别为97.5% (Jotun Hein)、96% (ClustalV)、96.4% (ClustalW); Aeromonas sp.T1与Genebank登录号为HM778461.1序列相似度最高,分别为97.1% (Jotun Hein)、93.8%(ClustalV)、94.5% (ClustalW); Aeromonas sp.T2与同样与Genebank登录号为HM778461.1序列相似度最高,分别为97.7% (Jotun Hein)、95.3% (ClustalV)、96.8% (ClustalW).4种方法构建的系统发育树基本一致,可初步确立2株菌株的分类地位:Aeromonas sp.T1、Aeromonas sp.T2与登录号为HM127065.1的曹株的聚为一类,亲缘关系最近.

关键词：气单胞菌(Aeromonas)、16S rDNA、分子鉴定

所属期刊栏目：8

分类号：Q939(微生物学)

资助基金：长江大学博士启动基金801200010110

在线出版日期：2011-12-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：257-262