黑果枸杞XTH转录因子家族鉴定与生物信息学分析

摘要：

为探究木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶(Xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTHs)基因家族在黑果枸杞(Lycium ruthenicum)生长发育中的作用,以及对盐胁迫的响应,本文通过生物信息学方法对XTHs基因的理化性质、保守结构域、进化关系和表达模式进行分析.从黑果枸杞转录组数据中共筛选出19个LrXTHs成员,其编码氨基酸的数目为258～330 aa,分子量为29.77～37.98 kDa,等电点为4.98～8.92,基因长度为954～1814 bp.LrXTHs成员都含DE(I/L/F/V)D(F/I/M)EFLG保守结构域.系统发育树显示XTH基因家族可分为4个亚族.基因表达谱显示不同组织中的LrXTHs在盐胁迫下具有不同的表达趋势,LrXTH3,LrXTH18和LrXTH19在根部组织中高表达,LrXTH9在根部和叶部组织中高表达,表明LrXTHs可能在黑果枸杞的盐胁迫响应中发挥重要作用.该结果为黑果枸杞及XTH家族的进一步研究提供了参考.

关键词：黑果枸杞、NaCl胁迫、XTH转录因子、生物信息学、系统发育树

所属期刊栏目：31

分类号：S722.3+6(造林学、林木育种及造林技术)

资助基金：甘肃省高校产业支撑计划项目;兰州资源环境职业技术大学重点研究项目;兰州市科技计划项目

在线出版日期：2023-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：2916-2924